具3´→5´核酸外切酶活性，用于非定向巢式缺失，定点突变，链特异性探针的制备，制备用于双脱氧测序的单链底物。该酶作用于双链 DNA，从 3´ OH 末端逐步切去单核苷酸。每次酶与底物结合催化，只有几个核苷酸被除掉，从而在 DNA 分子群内产生渐进缺失。

从 3´→5´ 方向水解单链 DNA 的外切酶活性。用于PCR 扩增后降解引物

Cas9 Nuclease, S. pyogenes, 50 pmol cas9核酸酶，是一种能够催化双链DNA特异位点切割的导向RNA内切酶，50pmol，1000nM相当于159ng/ul。

具3´→5´核酸外切酶活性，用于非定向巢式缺失，定点突变，链特异性探针的制备，制备用于双脱氧测序的单链底物。该酶作用于双链 DNA，从 3´ OH 末端逐步切去单核苷酸。每次酶与底物结合催化，只有几个核苷酸被除掉，从而在 DNA 分子群内产生渐进缺失。

作用于双链 DNA，沿 5´→3´ 方向催化去除 5´ 单核苷酸，它既能从 5´ 末端起始消化，也能从双链 DNA 的切刻或缺口处起始消化。它既能降解 5´ 磷酸化 DNA 也能降解 5´ 去磷酸化 DNA。据报道，它能沿 5´→3´ 方向降解 RNA/DNA 杂交双链上的 RNA 或 DNA，但不能降解双链或单链 RNA。

一种单链 DNA 或 RNA 特异性的核酸内切酶，可以从 DNA 或 RNA 分子的末端降解单链突出端，产生可连接的平齐末端。用于除去DNA或RNA分子的 3 ´或 5 ´突出末端，形成可以用连接酶连接的平齐末端，切割发夹结构中的 loop 环，从基因组 DNA 中切除基因编码序列，产生新的限制性酶切位点

核糖核酸酶 If（RNase If）是一种单链特异性 RNA核酸外切酶，能够切割所有 RNA二核苷酸键，产生 5´ 羟基和 2´，3´ 环状单核苷酸。重组RNase If 是大肠杆菌 RNase I 与麦芽糖结合蛋白的融合蛋白，与野生型 RNase I 具有相同活性。用于核糖核酸酶保护试验；去除 DNA和蛋白质制备过程中的RNA；降解单链RNA 生成单、二或三核苷酸

内切糖苷酶的对照底物.RNase B is a high mannose glycoprotein (1-3) that can be used as a positive control for endoglycosidases that cleave N-linked carbohydrates. RNase B has a single N-linked glycosylation site which makes it ideal for SDS-PAGE gel shift assays.

用于从两端逐步对双链 DNA 进行切割。BAL-31核酸外切酶降解双链 DNA 的 3´ 和 5´ 末端，不切割分子内部。该酶同时还是高度特异性的单链核酸内切酶，在切刻、缺口、双链 DNA 单链区和双链 RNA 的单链区进行切割。

从 3´→5´ 方向水解单链 DNA 的外切酶活性。用于PCR 扩增后降解引物

去除线性单链、双链 DNA 和切刻质粒 DNA，但对超螺旋质粒 DNA 不起作用。T5 核酸外切酶沿 5´→3´ 方向降解 DNA。它既能从 5´ 末端起始消化，也能从线性或环状双链 DNA 的切刻或缺口处起始消化。但不能降解超螺旋双链 DNA，T5 核酸外切酶还具有单链 DNA 核酸内切酶活性。

RecJf作用于单链 DNA，沿 5´→3´ 方向催化去除单磷酸脱氧核苷酸。RecJf与麦芽糖结合蛋白（MBP）融合表达，增强了 RecJf 的溶解度。特异性 5´→3´ 单链 DNA 核酸外切活性，用于从 DNA 上切下单磷酸脱氧核苷酸。
当底物为 5´ 端突出了 22 个核苷酸的 DNA 时，经 RecJf 酶切后可得到含有以下三种末端的混合产物：平齐末端、5´ 突出末端（1-5 个核苷酸）和 5´ 凹陷末端（1-8 个核苷酸）。RecJf 发挥活性时无需 5´ 末端磷酸化。

特异地作用于单链 DNA 或 RNA，使 DNA 或 RNA 的 3´ 突出端变为平齐末端。核酸外切酶 T（Exo T）又称核糖核酸酶 T（RNase T），沿 3´→5´ 方向特异性作用于单链 RNA 或 DNA 的 3´ 突出游离端。核酸外切酶 T 作用于 3´ 突出游离端，产生平末端的 RNA 或 DNA 分子。

E. coli 核酸内切酶 Ⅲ（Nth）既有 N-糖基化酶活性也有 AP-裂解酶活性。N-糖基化酶活性可释放双链 DNA 上受损的嘧啶碱基，产生一个脱嘧啶 (AP) 位点。AP-裂解酶活性则切割 AP 位点的 3´ 端，产生一个 5´ 磷酸和一个 3´ 磷酸-α,β不饱和醛。被核酸内切酶 Ⅲ 识别并切除的受损碱基包括：尿素、5,6-二羟基胸腺嘧啶、胸腺嘧啶乙二醇、5-羟基-5-甲内酰脲、尿嘧啶乙二醇、6-羟基-5,6-二羟基胸腺嘧啶和甲基羟丙二酰脲

一种核糖核酸内切酶，它能够特异性地水解杂交到 DNA 链上的 RNA 磷酸二酯键，故能降解 RNA/DNA 杂交体系中的 RNA 链。该酶不能消化单链或双链 DNA。用于除去杂交到 poly(dT) 上的 mRNA poly(A)； 在 cDNA 第二链合成时除去 mRNA

高效 5´→3´ 核酸外切酶活性，切下双链DNA的5 ´ 单核苷酸。Lamda核酸外切酶作用于双链 DNA，沿 5´→3´ 方向逐步切去 5´ 单核苷酸。更适底物是 5´ 磷酸化的双链 DNA，也能缓慢降解单链 DNA 和非磷酸化底物。该酶不能从 DNA 的切刻或缺口处起始消化。

核酸内切酶，无论甲基胞嘧啶*是在DNA 的一侧链上还是在对侧链上，McrBC 都能切割。对未甲基化的DNA，McrBC 无作用。DNA上McrBC的识别位点由两个（G/A）mC 形式的半位点组成，这两个半位点之间的距离可以达到 3kb，但是更佳的距离为55 -103bp。McrBC 的切割需要 GTP，当存在不可水解的GTP 的类似物时，该酶可以特异地结合到甲基化DNA 上，但不能进行切割。McrBC 作用于一对PumCG序列元件，以此检测高比例甲基化的 CpGs，但是不能识别内部胞嘧啶甲基化了的 HpaII/MspI 位点（CCGG）

非特异性核酸内切酶，切割 DNA 产生具有 3´ 羟基和 5´ 磷酸末端的二核苷酸、三核苷酸和寡核苷酸产物。DNase I 可以作用于单链 DNA、双链 DNA、染色质和 RNA:DNA 杂交链。可用于转录反应后 DNA 模板的降解；除去 RNA 样品中污染的基因组 DNA；DNase I 印迹分析法；切刻翻译

一种非特异性的核酸内切酶和核酸外切酶。该酶从重组 E. coli 菌株纯化得到，可消化双链、单链、环化以及线性的核酸。在 pH 7.0-10.0 的范围内，微球菌核酸酶均有活性，无论对于 DNA 底物还是 RNA 底物，其更适 pH 值均为 9.2。微球菌核酸酶偏向于切割富含腺苷酸、脱氧腺苷酸或胸腺苷酸的底物。酶切 DNA 和 RNA 底物产生带有 3´ 磷酸的单核苷酸和二核苷酸。用于蛋白质制备中降解核酸，体外翻译，在非机械细胞裂解液制备时降低细胞裂解液的粘性，染色质结构分析，快速 RNA 测序，ChIP 分析

核酸内切酶 IV 能够作用于 DNA 分子上的几种氧化性损伤。该酶是一个脱嘌呤/脱嘧啶（AP）核酸内切酶，水解 DNA 上的完整 AP 位点。切割 AP 位点 5´ 端的个磷酸二酯键，产生 3´ 羟基和 5´ 脱氧核糖磷酸末端。该酶也具有 3´ 二酯酶活性，能从 DNA 的 3´ 末端释放磷酸甘油醛、完整的脱氧核糖 5´ -磷酸和磷酸。

一种 DNA 修复酶，切割含脱氧次黄嘌呤核苷的寡核苷酸，切割错配。核酸内切酶 V 对错配脱氧次黄嘌呤核苷 3´ 端第二个或第三个磷酸二酯键进行切割，切割第二个磷酸二酯键的效率是 95%，第三个磷酸二酯键的效率是 5%，产生一个 3´ 羟基、5´ 磷酸的切刻。

既有 N-糖基化酶活性也有 AP-裂解酶活性。N-糖基化酶活性可释放双链 DNA 上受损的嘧啶碱基，产生一个脱嘧啶 (AP) 位点。AP-裂解酶活性则分别在 AP 位点的 3´ 和 5´ 端切割磷酸二酯键，产生 5´ 磷酸和 3´ 磷酸末端。能被核酸内切酶 Ⅷ 识别并切除的受损碱基包括：尿素、5,6-二羟基胸腺嘧啶、胸腺嘧啶乙二醇、5-羟基-5-甲内酰脲、尿嘧啶乙二醇、6-羟基-5,6-二氢胸腺嘧啶和甲基羟丙二酰脲。尽管核酸内切酶 Ⅷ 与核酸内切酶 Ⅲ 的活性相似，但核酸内切酶 Ⅷ 具有 β 和 δ 裂解酶活性，而核酸内切酶 Ⅲ 只有 β 裂解酶活性。

核糖核酸酶 H II（RNase H II）为核糖核酸内切酶，适用于在双链 DNA 内部切刻核糖核酸的 5´末端，产生 5´ 磷酸和 3´ 羟基末端。RNase HII 还可以在冈崎片段的 RNA 部分进行多处切割。用于降解冈崎片段或其它RNA-DNA杂交链中的RNA部分；切刻聚合酶产物，掺入核糖核苷酸；或者与T7 核酸内切酶 I 联合使用时，在掺入有核糖核苷酸区域位点处产生一个双链的缺口。

T7 核酸内切酶 I 识别并切割不完全配对 DNA、十字型结构 DNA、Holliday 结构或交叉 DNA、异源双链DNA 或者以更慢的速度切割含切刻的双链 DNA。该酶切割错配碱基 5´ 端的、第二或第三个磷酸二酯键。用于识别错配 DNA；分解四方向交叉 DNA 或分支 DNA；检测或切割异源二聚体 DNA 和切刻 DNA；随机切割线性 DNA 进行 shot-gun 克隆

去除线性单链和双链 DNA，但对切刻和超螺旋质粒 DNA 无作用。核酸外切酶 V 是从 E. coli 提取的 RecBCD 复合蛋白，具有几种不同的活性，包括 ATP 依赖型单链 DNA 内切酶活性、单链和双链 DNA 外切酶活性。反应具有双向（3´ 和 5´ 端）持续性，产物为寡脱氧核苷酸（1,2,3）。所有核酸外切酶 V 的酶活都需要二价阳离子参与，外切酶活性需要 Mg2+，Ca2+ 会抑制外切酶活性，并有解旋酶活性，将双链 DNA 打开，但不水解（4,5）。

该酶为 E. coli 核酸内切酶 Ⅲ（Nth）的热稳定同源蛋白。既有 N-糖基化酶活性也有 AP-裂解酶活性。N-糖基化酶活性可释放双链 DNA 上受损的嘧啶碱基，产生一个脱嘧啶（AP）位点。AP-裂解酶活性随后对该位点进行切割。Tma 核酸内切酶 Ⅲ 识别 DNA 上的无碱基位点、5,6-二羟基胸腺嘧啶和胸腺嘧啶乙二醇。