尽管可以作用于双链 DNA 的切刻产生单链缺口，但该酶更适底物是平齐末端或 3´ 凹陷末端 DNA。由于对单链 DNA 无活性，因此该酶无法切割 3´ 突出末端。3´ →5´ 外切酶活性对底物的切割程度随 3´ 突出末端的长度而变化，四碱基或更长的突出末端完全不能被切割。这种特性可以用于对一端为抗性位点（3´ 突出端），另一端是敏感位点（平端或 5´ 突出端）的线性 DNA 分子进行单方向切割。

具有从 3´ →7´ 方向水解单链 DNA 的外切酶活性。

Cas9 核酸酶，S. pyogenes，是 RNA 介导的核酸酶，可以催化双链 DNA 的特异位点切割。其在PAM（Protospacer Adjacent Motif）上 NGG 处，靶序列的 3 个碱基内进行切割。PAM 序列的 NGG 必须连在靶点之后，位于与 sgRNA 互补的 DNA 的对链上。

Nuclease P1 (from P. citrinum) is a zinc-dependent single-strand specific nuclease which hydrolyzes 3′->5′ phosphodiester bonds in RNA and ssDNA with no base specificity. Nuclease P1 also exhibits 3′-phosphomonoesterase activity (1). Although a single-strand specific nuclease (ssDNA and RNA-specific), Nuclease P1 does display some activity toward dsDNA in Nuclease P1 Reaction Buffer. If preferentially degrading single-stranded nucleic acids (ssDNA or RNA) in the presence of double stranded DNA (dsDNA), we recommend using Nuclease P1 in 1X NEBuffer 1.1 to limit activity on dsDNA while maintaining single-strand nuclease activity.

EnGen® Spy dCas9 is an inactive mutant of Cas9 nuclease that retains programmable DNA binding activity (1,2). EnGen Spy dCas9 contains two point mutations, D10A and H840A, which inactivate its RuvC and HNH nuclease domains, respectively. The N-terminal SNAP-tag® allows for covalent attachment of fluorophores, biotin, and a number of other conjugates useful for visualization and target enrichment. Like with Cas9 nuclease, DNA binding by EnGen Spy dCas9 requires a guide RNA complementary to a target sequence with a protospacer adjacent motif (PAM), NGG, downstream of the target sequence. EnGen Spy dCas9 contains a SV40 T antigen nuclear localization sequence (NLS) at the C- terminus of the protein. Product Source EnGen® Spy dCas9 is expressed as a N-terminal 6XHis-tagged fusion in E. coli. Reagents Supplied The following reagents are supplied with this product Store at (°C) Concentration NEBuffer™ 3.1 -20 10X

EnGen® Spy Cas9 Nickase is a variant of Cas9 nuclease differing by a point mutation (D10A) in the RuvC nuclease domain, which enables it to nick, but not cleave, DNA (1,2). EnGen Spy Cas9 Nickase, like EnGen Cas9 NLS (NEB #M0652), targets DNA using a guide RNA complementary to a site with a 3’ NGG protospacer adjacent motif (PAM). Nicking occurs on the DNA strand opposite the PAM. Double-stranded DNA breaks can be generated with reduced off-target cleavage by targeting two sites in close proximity (generally 0-20 bp apart) and with PAMs facing outward to leave 5’ overhangs. Nicking by EnGen Spy Cas9 Nickase occurs on the DNA strand opposite the target sequence. EnGen Spy Cas9 Nickase contains SV40 T antigen nuclear localization (NLS) sequences on the N and C- termini.

尽管可以作用于双链 DNA 的切刻产生单链缺口，但该酶更适底物是平齐末端或 3´ 凹陷末端 DNA。由于对单链 DNA 无活性，因此该酶无法切割 3´ 突出末端。3´ →5´ 外切酶活性对底物的切割程度随 3´ 突出末端的长度而变化，四碱基或更长的突出末端完全不能被切割。这种特性可以用于对一端为抗性位点（3´ 突出端），另一端是敏感位点（平端或 5´ 突出端）的线性 DNA 分子进行单方向切割。

本酶作用于双链 DNA，沿 5´ →3´ 方向催化去除 5´ 单核苷酸，它既能从 5´ 末端起始消化，也能从双链 DNA 的切刻或缺口处起始消化。它既能降解 5´ 磷酸化 DNA 也能降解 5´ 去磷酸化 DNA。据报道，它能沿 5´ →3´ 方向降解RNA/DNA 杂交双链上的 RNA 或 DNA，但不能降解双链或单链 RNA。

本品是一种单链 DNA 或 RNA 特异性的核酸内切酶，可以从 DNA 或 RNA 分子的末端降解单链突出端，产生可连接的平齐末端。

具有从 3´ →6´ 方向水解单链 DNA 的外切酶活性。

RNase B是一种高甘露糖蛋白，可作为糖苷内切酶切割N-连接糖链的阳性对照。RNase B有一个N-连接糖基化位点，可以用于SDS-PAGE凝胶电泳分析。

RecJf 作用于单链 DNA，沿 5´ →3´ 方向催化去除单磷酸脱氧核苷酸。RecJf 与麦芽糖结合蛋白（MBP）融合表达。增强了 RecJf 的溶解度。

核酸外切酶 T（Exo T）又称核糖核酸酶 T（RNase T），沿 3´ →5´ 方向特异性作用于单链 RNA 或 DNA 的 3´ 突出游离端。核酸外切酶 T 作用于 3´ 突出末端，产生平末端的 RNA 或 DNA 分子。

核糖核酸酶 H（RNase H）是一种核糖核酸内切酶，它能够特异性地水解杂交到 DNA 链上的 RNA 磷酸二酯键，故能降解 RNA/DNA 杂交体系中的 RNA 链。该酶不能消化单链或双链 DNA。

Lambda 核酸外切酶作用于双链 DNA，沿 5´→3´ 方向逐步切去 5´ 单核苷酸。更适底物是 5´ 磷酸化的双链 DNA，也能缓慢降解单链 DNA 和非磷酸化底物。该酶不能从 DNA 的切刻或缺口处起始消化。

核糖核酸酶 If（RNase If）是一种 RNA 核酸内切酶，能够切割所有 RNA 二核苷酸键，产生 5´ 羟基和 2´ ，3´ 环状单核苷酸。该酶降解单链 RNA 的能力比双链 RNA 的能力强。重组 RNase If 是大肠杆菌 RNase I （来源于 E. coli ）与麦芽糖结合蛋白的融合蛋白，与野生型 RNase I 具有相同活性。

DNase I（无 RNase）是一种非特异性核酸内切酶，切割 DNA 产生具有 3´ 羟基和 5´ 磷酸末端的二核苷酸、三核苷酸和寡核苷酸产物。DNase I 可以作用于单链 DNA、双链 DNA、染色质和 RNA:DNA杂交链。

T7 核酸内切酶 I 识别并切割不完全配对 DNA、十字型结构 DNA、Holliday 结构或交叉 DNA、异源双链 DNA 或者以更慢的速度切割含切刻的双链 DNA。该酶切割错配碱基 5´ 端的、第二或第三个磷酸二酯键。

该产品是 T5 核酸外切酶（NEB #M0363，已停产）的替代产品。T5 核酸外切酶沿 5’→3’方向降解 DNA。它既能从 5’末端起始消化，也能从线性或环状双链 DNA 的切刻或缺口处起始消化。但不能降解超螺旋双链 DNA。T5 核酸外切酶还具有单链 DNA 核酸内切酶活性。

微球菌核酸酶来源于金黄色葡萄球菌（Staphylococcus aureus），是一种非特异性的核酸内切酶和核酸外切酶。该酶从重组 E. coli 菌株纯化得到，可消化双链、单链、环化以及线性的核酸。在 pH 7.0-10.0 的范围内，微球菌核酸酶均有活性，无论对于 DNA 底物还是 RNA 底物，其更适 pH 值均为 9.2。微球菌核酸酶偏向于切割富含腺苷酸、脱氧腺苷酸或胸腺苷酸的底物。酶切 DNA 和 RNA 底物产生带有 3´ 磷酸的单核苷酸和二核苷酸。

E. coli 核酸内切酶 III（Nth）既有 N-糖基化酶活性也有 AP-裂解酶活性。N-糖基化酶活性可释放双链 DNA 上受损的嘧啶碱基，产生一个脱嘧啶（AP）位点。AP-裂解酶活性则切割 AP 位点的 3´ 端，产生一个 5´ 磷酸和一个 3´ 磷酸-α,β不饱和醛。

核酸外切酶 V 是从 E. coli 提取的 RecBCD 复合蛋白，具有几种不同的活性，包括 ATP 依赖型单链 DNA 内切酶活性、单链和双链 DNA 外切酶活性。反应具有双向（3´ 和 5´ 端）持续性，产物为寡脱氧核苷酸。所有核酸外切酶 V 的酶活都需要二价阳离子参与，外切酶活性需要 Mg2+，Ca2+ 会抑制外切酶活性，并有解旋酶活性，将双链 DNA 打开，但不水解。

核酸内切酶 IV 能够作用于 DNA 分子上的几种氧化性损伤。该酶是一个脱嘌呤/脱嘧啶（AP）核酸内切酶，水解 DNA 上的完整 AP 位点。切割 AP 位点 5´ 端的个磷酸二酯键，产生 3´ 羟基和 5´ 脱氧核糖磷酸末端。该酶也具有 3´ 二酯酶活性，能从 DNA 的 3´ 末端释放磷酸甘油醛、完整的脱氧核糖 5´ -磷酸和磷酸。

核酸内切酶 V 是在 E. coli 中发现的一种 DNA 修复酶。它识别 DNA 中的脱氧次黄嘌呤核苷，即脱氧腺苷的去氨基产物。核酸内切酶 V，也称为脱氧次黄嘌呤核苷 3´ 内切酶，识别含脱氧次黄嘌呤核苷（无论配对与否）的双链或单链 DNA。也可识别含脱碱基（AP）位点或尿素、碱基错配、插入/缺失错配、发夹结构、未配对 loop 环、折叠 flaps 和类 -Y 型结构的 DNA，但是识别后者的能力不如前者。普遍认为核酸内切酶 V 发挥 DNA 修复功能时，还需另外一种蛋白的存在，因为它不能切除 DNA 上的脱氧次黄苷或受损碱基。

核糖核酸酶 HII（RNase HII）为核糖核酸内切酶，适用于在双链 DNA 内部切刻核糖核酸的 5´ 末端，产生 5´ 磷酸和 3´ 羟基末端。RNase HII 还可以在冈崎片段的 RNA 部分进行多处切割。

大肠杆菌核酸内切酶 VIII 既有 N-糖基化酶活性也有 AP-裂解酶活性。N-糖基化酶活性可释放双链 DNA 上受损的嘧啶碱基，产生一个脱嘧啶（AP）位点。AP-裂解酶活性则分别在 AP 位点的 3´ 和 5´ 端切割磷酸二酯键，产生 5´ 磷酸和 3´ 磷酸末端。能被核酸内切酶 VIII 识别并切除的受损碱基包括：尿素、5,6-二羟基胸腺嘧啶、胸腺嘧啶乙二醇、5-羟基-5-甲内酰脲、尿嘧啶乙二醇、6-羟基-5,6-二氢胸腺嘧啶和甲基羟丙二酰脲 。尽管核酸内切酶 VIII 与核酸内切酶 III 的活性相似，但核酸内切酶 VIII 具有 β 和 δ 裂解酶活性，而核酸内切酶 III 只有 β 裂解酶活性。

Monarch RNase A 是 Monarch 基因组 DNA 提取试剂盒（NEB＃T3010）的一个组份，可用于纯化多种样品类型的基因组 DNA。 RNase A 处理为纯化过程中的可选步骤，可去除残留 RNA。这种高品质的酶是从牛胰腺中提取的，不含 DNase、蛋白酶和 DNA。 以 20 mg/ml 的溶液形式提供（ 50％ 甘油，50 mM Tris-Cl，pH 7.4）。

Tth 核酸内切酶 IV 是一种热稳定的脱嘌呤/脱嘧啶（AP）核酸内切酶。该酶切割 AP 位点 5´ 端的个磷酸二酯键，产生 3´ 羟基和 5´ 脱氧核糖磷酸末端。该酶也具有 3´ 二酯酶活性。

该酶为 E. coli 核酸内切酶 III（Nth）的热稳定同源蛋白。既有 N-糖基化酶活性也有 AP-裂解酶活性。N-糖基化酶活性可释放双链 DNA 上受损的嘧啶碱基，产生一个脱嘧啶（AP）位点。AP-裂解酶活性随后对该位点进行切割。

核酸酶 VIII 移除双链 DNA 5´ 末端的核苷酸。